Ebooks Gratuits

Bioinformatique - 3e éd.

Auteure: Gilbert Deléage , Manolo Gouy , Alexandre De Brevern

Nombre de pages: 240

La bioinformatique est une « interdiscipline » à la frontière de la biologie, de l’informatique et des mathématiques. Elle a pour but d'intégrer des données d’origines très diverses pour modéliser les systèmes vivants afin de comprendre et prédire leurs comportements. Ce livre aborde de manière simple les taches courantes en bioinformatique qu’un biologiste/biochimiste doit savoir traiter par lui-même sans avoir recours au spécialiste. Conçu de manière à faciliter la compréhension des approches, méthodes, algorithmes et implémentations les plus courantes en bioinformatique moléculaire et structurale, cette troisième édition actualisée leur permettra d’éviter les pièges classiques et de répondre aux questions usuelles : comment chercher dans les banques de données biologiques ? Peut-on reconstruire l’histoire évolutive des espèces grâce aux séquences biologiques ? Quelle peut être la fonction d’une protéine ? Comment construire un modèle 3D de protéine ?...

Cours sur l'introduction à la bioinformatique

Auteure: L. Pimonow

Programmation en Python pour les sciences de la vie

Auteure: Patrick Fuchs , Pierre Poulain

Nombre de pages: 288

Python est le langage de programmation le plus répandu dans le monde scientifique. Il est parfaitement adapté pour l’analyse de données en sciences de la vie. Cet ouvrage, didactique et simple d'approche, aborde progressivement la programmation et l'algorithmique. Il présente ensuite des fonctionnalités plus avancées utiles en analyse de données (numpy, pandas, matplotlib, notebooks jupyter), ainsi qu’une introduction à la programmation orientée objet et graphique. L’ouvrage s’appuie sur de nombreux exemples provenant de la biologie, comme la manipulation de séquences nucléiques, l’analyse de structures protéiques, etc. De nombreux exercices d’application, de difficulté croissante, sont proposés et corrigés en détails. L’ensemble des codes sources de l’ouvrage est disponible en ligne.

Bio-informatique

Auteure: Denis Tagu , Jean-loup Risler

Nombre de pages: 284

Située à l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du « paysage » des laboratoires s'intéressant de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l'évolution des génomes. Pour tous les intervenants, s'approprier les outils d'analyse, de stockage et de visualisation des séquences d'acides nucléiques et d'acides aminés est devenu une nécessité. Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils à disposition et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi d'en faire un usage raisonné.

Cours sur l'introduction à la bioinformatique

Auteure: L. Pimonow

Cours de python

Auteure: Patrick Fuchs , Pierre Poulain

Nombre de pages: 140

Biochimie - Tout le cours en fiches - 2e éd

Auteure: Norbert Latruffe , Françoise Bleicher-bardeletti , Bertrand Duclos , Joseph Vamecq

Nombre de pages: 528

Cet ouvrage fait la synthèse en 200 fiches des concepts fondamentaux de la biochimie structurale et métabolique enseignés dans les premières années d’études supérieures (Licences de Sciences de la Vie et de la Santé, première année des études de santé, IUT de Génie Biologique). La présentation est adaptée aux besoins des étudiants préparant un examen ou un concours : fiches synthétiques pour comprendre, QCM pour s’évaluer, sujets de synthèse pour s’entraîner. Dans cette seconde édition, actualisée, la partie métabolisme a été profondément remaniée pour être encore plus accessible.

Bioinformatique

Auteure: Gilbert Deléage , Manolo Gouy , Alexandre De Brevern

Nombre de pages: 227

Cours sur l'introduction à la bioinformatique

Auteure: Léonid Pimonow

Nombre de pages: 205

Cours sur l'introduction à la bioinformatique de l'audition

Auteure: Léonid Pimonow

Cours sur l'introduction à la bioinformatique

Auteure: Léonid Pimonow

Cours sur l'introduction à la bioinformatique....

Auteure: Léonid Pimonow

Nombre de pages: 646

Méthodes d’étude et d’analyse du génome (Cours + QCM)

Auteure: Serge Romana , Jean-paul Bonnefont , Marina Cavazzana-calvo , Valérie Malan , Jean-philippe Jaïs

Nombre de pages: 160

La collection Pass'Santé couvre l'ensemble des enseignements du tronc commun et des 4 filières de la PACES. LesCours + QCM offrent "à la carte" les enseignements des concours concernés. Cet ouvrage couvre les items du module Méthodes d'étude et d'analyse du génome inscrits au programme de la PACES. Le 1er chapitre traite de la composition, de l'organisation et des variations du génome humain ainsi que de l'architecture des chromosomes. Les 2 chapitres suivants exposent les méthodes d'exploration du génome, d'une part par les techniques de génétique moléculaires et plus particulièrement des méthodes d'études des génomes « normal » et « pathologique » et d'autre part les techniques de cytogénétiques classiques et moléculaires. Le chapitre 4 envisage ensuite la place de la thérapie génique dans le traitement des génomes pathologiques. Sont détaillés les concepts de base, les différents types de vecteurs, les stratégies de corrections géniques ainsi que les risques de son utilisation. Enfin, le dernier chapitre traite de l'utilisation de la bio-informatique dans l'analyse du génome et de son expression : utilisation des banques de données et principes ...

Cours sur l'introduction à la bioinformatique

Auteure: Léonid Pimonow

Nombre de pages: 219

Etude bioinformatique de l'épigénome au cours de la différenciation des lymphocytes T et des leucémies

Auteure: Mohamed Belhocine

Nombre de pages: 173

Des études récentes ont mis en évidence qu'au moins 70% du génome humain est transcrit et produit une myriade d'ARN non codants. Au début de ma thèse j'ai utilisé des données de RNA-Seq sens-spécifique pour identifier les transcrits divergents dans les tissus primaires de souris. J'ai utilisé aussi des données ChIP-Seq afin d'analyser leurs caractéristiques épigénétiques. Nous avons trouvé que la transcription divergente est associée de manière significative à des gènes liés à la régulation de la transcription et le développement.Dans un deuxième temps, je me suis intéressé à l'identification et la caractérisation des lncRNA chez l'homme. J'ai appliqué des approches statistiques pour quantifier leur expression et identifier ceux qui sont (dé)régulés dans un contexte normal ou leucémique Dans un troisième temps. Au cours de ma thèse, je me suis attaché à étudier le mécanisme moléculaire épigénomique ainsi qu'à développer un pipeline bioinformatique permettant d'identifier les gènes (codant ou non codant) associés à des profils H3K4me2/3 étendus. Ainsi, j'ai mis en évidences que ces profils étendus étaient directement dépendants...

Amelioration Genetique des Plantes

Auteure: Adel Amar Amouri

Nombre de pages: 38

Seminar paper de l’année 2017 dans le domaine Sciences Agronomiques, , cours: LMD « Sciences Biologiques et Agronomiques, langue: Français, résumé: Ce modeste livre aborde une science assez importante pour le développement durable dans le domaine de l’agriculture, c’est l’Amélioration Génétique des Plantes. Cette branche de la biologie qui est d’un aspect multidisciplinaire a pour but de créer de nouvelles variétés de plantes qui satisfait le besoins des populations de point de vue nutritionnel et santé publique, ceci afin d’assurer une bonne sécurité alimentaire d’un pays à long terme. L’amélioration des plantes est en continuel évolution surtout avec le développement des techniques récentes de Biologie Moléculaire, du Génie Génétique, de la Génomique et de la Bioinformatique, qui ont contribué efficacement et d’une façon rapide pour créer des variétés végétales nouvelles en se basant sur la grande diversité végétale existante dans le monde. Cet Aide mémoire donne une approche empirique et descriptive de la Génétique et l’Amélioration des Plantes depuis l’antiquité jusqu’à ce jour. Il est destiné principalement aux ...

Bioart

Auteure: Ernestine Daubner , Louise Poissant

Nombre de pages: 400

Biochimie structurale - Cours, fiches et QCM

Auteure: Lydie Bret , Clément Delcamp

Nombre de pages: 664

La collection PASS - Licence Santé propose des outils indispensables pour évaluer ses connaissances et son degré de compréhension des cours pour toutes les nouvelles matières de la PASS et de la LAS : Préparer les épreuves du nouveau concours ;Réviser régulièrement les notions fondamentales du cours et évaluer ses connaissances ;Compléter et améliorer ses révisions grâce à des entraînements complets.

La génomique en biologie végétale

Auteure: Jean-françois Morot-gaudry , Jean-françois Briat

Cet ouvrage illustre de façon claire et pédagogique les méthodes et les concepts qui sont à la base des progrès de la génomique en biologie végétale (grands programmes internationaux de séquençage, outils de la bio-informatique, méthodes d'analyse de l'expression des gènes incluant leurs produits métaboliques finaux et leur spécificité tissulaire et/ou cellulaire). Il rend compte des applications potentielles de la génomique dans les domaines de la génétique et de l'amélioration des plantes, de l'écophysiologie et de l'agronomie. Ce livre s'adresse aux étudiants de fin d'études universitaires ou agronomiques, aux professeurs de l'enseignement supérieur, aux techniciens, aux ingénieurs et scientifiques qui souhaitent acquérir des connaissances en génomique végétale.

Rapport de la VIIIe Table Ronde

Auteure: National Research Council Canada

Nombre de pages: 188

Ce compte rendu est un rapport de la VIIIe Table ronde du Forum d'innovation régional, l'une des nombreuses tables rondes de chefs de file de l'industrie organisées dans le cadre de la Stratégie d'innovation du Canada. Il résume les exposés des participants et les recommandations issues de deux ateliers surmonter les obstacles au développement de marchés pour les produits nouveaux, et stratégies commerciales pour créer des marchés pour les nouveaux produits. Comprend le programme de la Table ronde et la liste des participants.

Cours sur l'introduction a la bioinformatique

Auteure: Leonid Pimonow , École Pratique Des Hautes études (france)

Programmation en Perl

Auteure: Larry Wall , Tom Christiansen , Jon Orwant

Nombre de pages: 1072

L'eau à découvert

Auteure: Collectif

Nombre de pages: 365

Indispensable à la régulation du climat, au développement de la vie sur Terre, au maintien des écosystèmes, aux populations, au développement de l'agriculture, de l'industrie comme à la production d'énergie, l'eau est un élément vital. Il convient donc, dans un contexte de changement global, d'analyser dans toute sa diversité la place et le rôle de l'eau et de se donner ainsi les moyens de mieux la préserver. Autour de cet enjeu qui engage toute l'humanité, Agathe Euzen, Catherine Jeandel et Rémy Mosseri ont réuni près de cent cinquante contributions, visant à apporter un éclairage sur chacun des domaines et des approches que couvre cette thématique. Quelle est l'origine de l'eau ? Son rapport avec l'apparition de la vie ? Quel rôle a-t-elle joué dans l'histoire de la planète et dans le développement de la vie végétale, animale et humaine ? Quel est son cycle ? Quelles sont ses propriétés chimiques ? Comment les sociétés se sont-elles emparées de cet élément précieux ? Allons-nous manquer d'eau ? L'eau est-elle source de conflits ? Comment l'eau est-elle gérée ? Comment recycle-t-on une eau polluée ? Quels sont les risques pour la santé...

La structure des protéines

Auteure: Jeannine Yon-kahn , Guy Hervé , Jean-luc Popot

Nombre de pages: 208

Cet ouvrage couvre les différents aspects de la structure des protéines : leur composition chimique, l’établissement de leur structure, les différents niveaux de leur organisation, les aspects énergétiques de leur stabilité, leur dynamique moléculaire et la prédiction théorique de leur structure, prenant en compte les résultats substantiels et significatifs obtenus au cours des dernières années. Le premier chapitre concerne la chimie de leurs constituants de base, les acides aminés, connaissance qui est précieuse pour les chimistes des protéines et les enzymologistes mais dont les données sont dispersées dans la littérature. Pour la première fois dans ce type d’ouvrage un chapitre entier est consacré aux protéines membranaires, dans la connaissance desquelles des progrès considérables ont été faits au cours des dernières années. Suit une description des mécanismes très élaborés de l’insertion de ces protéines dans les membranes biologiques. Un chapitre est consacré à la dynamique conformationnelle de ces macromolécules, qui joue un rôle fondamental dans leurs propriétés biologiques. Les logiciels qui permettent de prédire la structure...

Travaux dirigés de biochimie, biologie moléculaire et bioinformatique

Auteure: Gérard Coutouly , Émile Klein , Éric Barbieri , Mostafa Kriat

Nombre de pages: 372

Les études des sciences de la vie, c'est-à-dire de biologie, ne sauraient actuellement se concevoir sans celle des biomolécules. Etudier des biomolécules ne peut plus se limiter à exposer divers résultats concernant leurs structures et leurs propriétés. Il importe également de connaître la manière dont ces résultats peuvent être obtenus d'où l'importance de la connaissance et la maîtrise des techniques d'analyse et de dosage de ces biomolécules. Cette quatrième édition des Travaux dirigés de biochimie, biologie moléculaire et bio-informatique offre aux élèves et aux étudiants, en plus d'un résumé de cours que chaque professeur aura à coeur d'adapter à ses objectifs pédagogiques et au niveau de ses élèves, des exercices variés permettant l'acquisition d'une certaine maîtrise de la manière dont les résultats expérimentaux sont obtenus. Elle prend en compte la notation des grandeurs et des constantes qui doit être désormais utilisée.

Enseigner et former dans le supérieur 2e éd.

Auteure: Jean-françois Parmentier , Quentin Vicens

Nombre de pages: 208

Les bases pour bien construire son cours ? Un environnement propice à l'apprentissage ? L'interactivité en séance ? L'apport du numérique ? Vers une amélioration continue ? Découvrez 38 outils indispensables pour enseigner et former dans le supérieur à l'aide de stratégies interactives issues de la recherche. Chaque outil est présenté de façon visuelle sur 2 pages : schéma de synthèse, résumé de l'outil, objectif et contexte d'utilisation, méthodologie à suivre, avantages et précautions à prendre. Des exemples d'application en classe renforcent la pédagogie concrète du livre.

Algèbre et analyse

Auteure: Stéphane Balac , Frédéric Sturm

Nombre de pages: 1052

Cet ouvrage, réunissant en un tout cohérent algèbre et analyse, s'adresse de manière plus spécifique aux élèves de première année des cycles préparatoires intégrés des écoles d'ingénieurs mais peut être utilisé avec profit par les étudiants de DEUG scientifiques et d'IUT. Il est issu de l'enseignement dispensé par les auteurs dans la filière ASINSA qui est l'une des trois filières de premier cycle international de l'INSA de Lyon. A ce titre, il ne constitue pas seulement une somme de connaissances mathématiques de 1re année de l'enseignement supérieur mais vise à présenter de manière précise les résultats essentiels à une formation d'ingénieur généraliste. L'ouvrage est divisé en 20 chapitres regroupés en 5 grandes parties : ensembles numériques fondamentaux, polynômes et fractions rationnelles, algèbre linéaire, calcul différentiel et calcul intégral. Chaque chapitre contient de courts exercices visant à tester la bonne compréhension des notions introduites et se termine par quelques exercices de synthèse. Une correction détaillée et commentée de tous les exercices est fournie en fin de chapitre. Quelques éléments biographiques de...

Infidélité de transcription et carcinogénèse. Analyse bioinformatique et preuves de concept biologiques

Auteure: Marie Brulliard

Nombre de pages: 280

L'un des enjeux de la lutte contre le cancer réside dans la compréhension de l'hétérogénéité de la maladie. Le but de notre travail a été d'explorer l'hétérogénéité des cellules cancéreuses du point de vue de la séquence d'ARN messager. Les ESTs (ou Expressed Sequence Tags) d'origine humaine ont été alignées aux séquences de référence ARNm. Les alignements ont été exploités de manière à mesurer les variations de séquence des ESTs issues de tissus tumoraux ou non tumoraux à chaque position de chaque transcrit. L'analyse statistique mise en place a consisté à identifier les positions pour lesquelles les variations de séquence, i.e. substitutions, insertions et délétions, sont différentes entre les ESTs d'origine tumorale et les ESTs d'origine non tumorale. L'étude bioinformatique s'est d'abord concentrée sur 17 transcrits abondamment exprimés avant d'être étendue à l'ensemble du transcriptome. Elle a ensuite été réalisée sur les ESTs murines. Les résultats montrent que l'hétérogénéité des transcrits cancéreux est plus grande que celle des tissus sains. Ainsi, l'infidélité de transcription est augmentée au cours de la...

Cyborg

Auteure: Laurent Poret

Nombre de pages: 150

Selon certaines définitions du terme, les attaches physiques que l'humanité a avec les technologies les plus élémentaires en ont déjà fait des cyborgs. Dans un exemple typique, un humain portant un stimulateur cardiaque artificiel ou un défibrillateur cardioverteur implantable serait considéré comme un cyborg, puisque ces dispositifs mesurent les potentiels de tension dans le corps, effectuent le traitement du signal et peuvent fournir des stimuli électriques en utilisant ce mécanisme de rétroaction synthétique pour garder cette personne en vie. Les implants, en particulier les implants cochléaires, qui combinent la modification mécanique avec n'importe quel type de réponse de rétroaction sont également des améliorations du cyborg. Certains théoriciens citent des modifications telles que les lentilles cornéennes, les prothèses auditives ou les lentilles intraoculaires comme exemples d'adaptation des humains à la technologie pour améliorer leurs capacités biologiques. Comme les cyborgs sont actuellement à la hausse, certains théoriciens soutiennent qu'il est nécessaire d'élaborer de nouvelles définitions du vieillissement et, par exemple, une...

Travaux dirigés de biochimie

Auteure: Gérard Coutouly , Emile Klein , Edouard Meyer

Nombre de pages: 279

One Health, une seule santé

Auteure: Jakob Zinsstag , Esther Schelling , David Waltner-toews , Maxine A. Whittaker , Marcel Tanner

Nombre de pages: 585

One Health, « Une seule santé », est une stratégie mondiale visant à développer les collaborations interdisciplinaires pour la santé humaine, animale et environnementale. Elle promeut une approche intégrée, systémique et unifiée de la santé aux échelles locale, nationale et mondiale, afin de mieux affronter les maladies émergentes à risque pandémique, mais aussi s'adapter aux impacts environnementaux présents et futurs. Bien que ce mouvement s’étende, la littérature en français reste rare. Traduit de l’anglais, coordonné par d’éminents épidémiologistes et s'appuyant sur un large panel d' approches scientifiques rarement réunies autour de la santé, cet ouvrage retrace les origines du concept et présente un contenu pratique sur les outils méthodologiques, la collecte de données, les techniques de surveillance et les plans d’étude. Il combine recherche et pratique en un seul volume et constitue un ouvrage de référence unique pour la santé mondiale.

Bulletin critique du livre français

Nombre de pages: 724

Biochimie de Harper

Auteure: Kathleen M Botham , Anthony Weil , Victor W Rodwell , Peter J Kennelly , David A Bender

Nombre de pages: 843

La 6e édition française de Biochimie de Harper combine des illustrations en couleurs de grande qualité à un exposé intégré des maladies biochimiques et des données cliniques. Par sa concision et les nombreux exemples médicaux pertinents, cet ouvrage présente une revue claire et succincte des bases de la biochimie que tout étudiant doit comprendre pour réussir ses études médicales.[...] Parmi les nouveautés traitées : les acides aminés toxiques naturels ; les biomolécules extra-terrestres ; la conception de médicaments assistée par ordinateur ; le rôle de la cascade du complément en cas d'infections bactériennes ou virales ; les médiateurs secrétés pour la signalisation intercellulaire entre les leucocytes ; le rôle des mastocytes, des basophiles et des éosinophiles ; le danger des antioxydants qui inhibent la signalisation pro-apoptotique en réponse aux espèces radicalaires, augmentant ainsi le risque de cancers [Source : 4e de couv.]

Bio-informatique moléculaire

Auteure: Pavel A. Pevzner

Nombre de pages: 315

Cet ouvrage est la traduction française d’un texte désormais considéré comme une référence dans le domaine émergent de la bio-informatique moléculaire. P. A. Pevzner y traite des cartes génétiques, du problème de comparaison de séquences et d’alignement en passant par les puces à ADN et le réarrangement génomique. Il couvre ainsi une grande variété de thèmes relatifs aux traitements algorithmiques et combinatoires de questions issues de la bioinformatique moléculaire et de la biotechnologie.

Communication et connaissance

Auteure: Collectif

Nombre de pages: 192

Depuis 25 ans, les technologies de l’information et de communication ont transformé le monde. En quelques années, le commerce, la finance, les échanges, l’école, le travail, la culture, la politique, etc. se sont totalement modifiés du fait de leur développement. Qu’on se remémore quelques-unes des étapes les plus marquantes de ces évolutions : apparition des mini puis des micro-ordinateurs, nouvelles interfaces avec utilisation de la souris et métaphore du bureau, essor des hypermédia, popularisation du Web, nomadisme généralisé, informatique vestimentaire, intelligence d’ambiance... Les changements ont été imaginés, conçus, développés, expérimentés dans des laboratoires de recherche. Partout, la recherche a pris, et continue de prendre, une part déterminante. Or, il est parfois difficile de discerner ce qui relève de la recherche fondamentale et du travail universitaire, de ce qui correspond à l’innovation industrielle. Qu’est-ce qui distingue la « R. et D. » — la recherche et développement Industriel — de la recherche universitaire ? Quelle part cette dernière prend-elle exactement dans l’innovation ? Quel rôle sera-t-elle amenée ...

La Banque des mots